La Unión Deportiva Marbella, se funda en el Año 1.997 por D. Antonio J. Pérez Ramos, formando su Junta Directiva y empezando su camino en Regional Preferente, temporada 97/98.

Temporada 1.997/1.998

Regional Preferente, Grupo VII. En esta temporada el Club apuesta como entrenador por Mané y de segundo entrenador por Paco Medina. Este año es glorioso en lo deportivo pues se consigue el ascenso a 3ª División en el campo del Arjonilla (Jaén).

Temporada 1.998/1.999

Tercera División, Grupo IX. Se apuesta por Paco Medina como entrenador, haciendo una temporada con muchos altos y bajos y quedando el club clasificado al final de la liga en 8ª posición. En esta temporada, el Club pierde a uno de sus jugadores más emblemáticos, Antonio Caro Peña, que cayó lesionado algunas jornadas antes de finalizar la liga y decide retirarse del fútbol como profesional y quedándose dentro de la entidad, siendo al día de hoy el actual Gerente.

Temporada 1.999/2.000

Tercera División, Grupo IX. Entrenador Jiménez Rueda. Este año se incorpora nuevamente como jugador Merino. A pesar de todo el Club vuelve a quedar clasificado al final de la Liga en 9ª posición.

Temporada 2.000/2.001

Tercera División, Grupo IX. Llega como entrenador José Luis Burgueña Arroyo. Se hace una magnifica temporada quedando el Club campeón de la 3ª División y jugando, por tanto, su primera liga de ascenso a 2ª División B. Los rivales de esta liguilla de ascenso fueron: Betis "B", Cuenca y Plasencia y lo más destacable de la misma fue que en las filas del Filial bético jugaban por entonces jugadores consolidados hoy en 1ª División como Joaquín, Dani o Doblas. En esta ocasión el Club no consiguió el ascenso.

Temporada 2.001/2.002

Tercera División, Grupo IX. Continúa en el banquillo costasoleño Burgueña. El Club juega este año la Copa de S.M Rey cayendo eliminado en la primera ronda por el C.D. Diter  Zafra. Este mismo año debuta como jugador Kepa, actualmente en las filas de Sevilla C.F de 1ª División y consiguiendo en su partido debut contra el Úbeda un gol de cabeza que dio la victoria a nuestro Club. Este mismo año, la Unión Deportiva Marbella juega un amistoso en el Municipal contra el Bayern de Munich siendo el resultado final de 0-0 y otro amistoso más contra el Alavés que en esos momentos dirigía Mané y cuyo resultado fue de 0-1. Al final de la liga, el Club quedó clasificado en 6ª posición.
En esta temporada el Club se clasifica como semifinalista de la Copa Real Federación Española de Fútbol, cayendo eliminado en el campo del Gavá.

Temporada 2.002/2.003

Tercera División, Grupo IX. Sigue José Luis Burgueña como entrenador. En esta temporada se decide traspasar a Kepa al Sevilla C.F. Se realiza una buena temporada quedando el Club clasificado en 2ª posición y jugando su 2ª Liguilla de Ascenso a 2ª División "B". Los rivales de esta liguilla fueron: A.D. Cerro Reyes Atco., C.D. Alcalá y C.D.Guadalajara. La Unión Deportiva Marbella no perdió ningún partido y consigue el tan ansiado ascenso a la categoría de bronce del Fútbol Español en el campo " Francisco Bono" del Alcalá de Guadaira con el resultado de 0-1 gol de Cipri y que desató la locura de todos los aficionados allí presentes, así como de toda  la afición blanquilla.

Temporada 2.003/2.004

Segunda División "B", Grupo IV. Continúa un año más Burgueña a cargo del equipo. Esta primera temporada de nuestro Club en 2ª B fue de adaptación pues el Club quedo clasificado en una 15ª posición pagando su inexperiencia en la categoría.

Temporada 2.004/2.005

Segunda División "B", Grupo IV. Accede al banquillo Antonio Gutiérrez Cuadrado. El equipo hace una buena temporada ya que se mantiene durante 33 jornadas dentro de los puestos que dan opción a jugar la Fase de Ascenso a Segunda "A", pero al final, a falta de dos jornadas para la conclusión del campeonato, el equipo se descuelga y queda clasificado finalmente en la 5ª posición de la tabla, a tan sólo 2 puntos del 4º Clasificado, el Lorca. El Marbella, aunque queda fuera de la fase de ascenso, si se clasifica para jugar la temporada siguiente la Copa de S.M. El Rey.

Temporada 2.005/2.006

Segunda División "B", Grupo IV. Entrenador Pablo Jesús Jiménez Ruiz. Se incorpora a la disciplina del Club Lorenzo Morón Vizcaíno "Loren", jugador emblemático natural de Marbella y muy querido en su localidad, procedente del Real Club Recreativo de Huelva de 1ª División recién descendido ese año a Segunda División y que ya militara en el extinto Club Atlético de Marbella. Se juega la 1ª ronda de la Copa de S.M El Rey y el Club cae eliminado ante el C.D Baza. Este mismo año el Club decide traspasar al jugador Nano al Nástic de Tarragona. Faltando 7 jornadas para finalizar la liga, el Club decide destituir a Pablo Jiménez e incorporar como nuevo entrenador a Juan Ramón López Muñiz, ex jugador consolidado en la 1ª División y procedente del Sporting de Gijón. Muñiz consigue que el equipo se mantenga en mitad de la tabla esa temporada.